Octobre 1493. Plusieurs mois se sont écoulés depuis que Francesca a déjoué le complot du prêtre fou qui voulait assassiner le pape, Rodrigo Borgia. La menace d'une guerre avec la France plane toujours et Borgia tente de peaufiner son alliance avec Ferdinand et Isabelle d'Espagne. Il envoie son fils aîné Juan à la cour espagnole pour parvenir à ses fins.